纯粹的指标 - 了解生态系统如何应对变化的气候

与ImageJ插件单元计数器(Cas0087560)显示(a)整个Herbarium记录纸和(b)一组得分的分支的特写镜头的示例。

随着气候变化加速,植物开花时间的记录变化对于了解气候变化将如何影响生态系统相互作用是至关重要的。目前,当研究人员使用干植物标本重建历史开花时期时,他们使用植物收藏的一天(DOY)作为代理的一天来估计第一或峰值开花时间。由于植物标目标本被收集在开花和结果的许多不同阶段(称为“纯粹的”阶段),因此使用收藏日的这种做法产生了摇摇欲剧的数据,这限制了我们估计生态系统如何应对转移气候的能力。

在最近发出植物科学申请的研究中,Natalie Love,M.S.及其同事制定了一种新的鉴效性鉴定性衡量标准,称为鉴别指标,以改善植物标本标本的发育阶段的评分。在纸质中,该团队使用自由软件包ImageJ,提出了一种用于以自动化方式导出植物标目标本的毒性指标的协议。

“植物标料标本可以从所有芽到所有水果的各种毒性阶段收集,所以假设在第一朵花或峰花的一天中收集的假设是不准确的,”稿件上的相应作者说和博士。加州大学圣塔巴巴拉的学生。“如果使用这些数据集的模型用于预测特定假定的苯相蛋白酶的一年的模型,这可能是特别问题的,这是学习候选的最终目标之一。”

“我们的方法允许研究人员能够预测特异性苯相糖基团的一天(如峰开花),而不是假设Doy相当于峰开花或第一朵花的日子,”爱情说。她的团队在Streptanthus Tortuosus中测试了新的方法,是芥末家族的小植物,原产于加利福尼亚山脉。他们发现将帖质指数措施堵塞到气候模型中改变了他们的结果。“使用我们的模式实际上预测了对气候变化的努力较高程度的候权,”爱情说。

作为瞄准数百万加利福尼亚植物标本标本的数字化项目同时推出鉴别指数和相关协议,称为捕获加州的花朵。“在完成这种大规模努力的情况下,我们希望提供具有新的和改进方法的危皮研究界,并将其分析了数百万额外的成像标本,即研究人员将很快获得,”爱情。

他们展示的工具将有助于了解这种数据的宝库,并提供超越加利福尼亚州的危身的研究人员,需要预测变化世界的生态反应所需的指标。

参考:“诸如苯气候模型中使用的新候权标准:用Streptanthus tortuosus的枸杞标本的案例研究由Natalie L. Rossington Love,Isaac W. Park和Susan J. Mazer,2019年7月12日,植物科学的应用.DOI:
10.1002 / APS3.11276

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