玩家准确地设计折叠蛋白质,就像专家创建的蛋白质一样真实

高分辨率x射线晶体学结果(灰色)与Foldit播放器设计的蛋白质模型(彩虹)的比较。横截面显示了核心侧链的详细比较。

蛋白质折叠的独特方式决定了它们与疾病和药物的相互作用,因此了解其曲折是设计有效药物的关键。

尽管新药设计是一项艰巨的工作,但发现蛋白质如何折叠也很有趣:一款名为Foldit的众包游戏,玩家可以尝试使用不同的倍数配置来获得积分和排名。在最近的挑战中,Foldit参与者提出了56种设计,这些设计在实验室中被复制为稳定的结构。

伯克利实验室高级光源的X射线研究证明,这些蛋白质中的三个真实结构与玩家生成的模型相匹配。使用称为核磁共振波谱学的技术验证了第四种蛋白质设计。

尽管事实证明,他们的模型与专家和复杂的计算机程序所创建的模型一样现实,但他们在这一领域的培训很少或没有接受过培训。他们的成功在《自然》杂志上发表的科学信函中得到了强调。

现在,在Foldit背后的华盛顿大学研究人员希望引入新的挑战,这些挑战可能导致玩家设计出比现有药物更好的实际药物。这些努力可能有益于不断发展的生物制药领域,在该领域中,现有蛋白质的副本及其修饰形式可用于对抗癌症和其他疾病。

华盛顿大学和Foldit开发商的研究科学家Brian Koepnick说:“现在我们已经看到游戏者可以准确地设计折叠蛋白,我们想向游戏者提出更棘手的设计难题。”

参考:Brian Koepnick,Jeff Flatten,Tamir Husain,Alex Ford,Daniel-Adriano Silva,Matthew J. Bick,Aaron Bauer,Liu hua,Yojiro Ishida,Alexander Boykov,Roger D. Estep,Susan撰写的“公民科学家的从头蛋白质设计”克莱因费尔特(Kleinfelter),托克(TokeNørgård-Solano),琳达·韦(Linda Wei),Foldit Players,盖塔诺·T·蒙特利昂(Gaetano T.
10.1038 / s41586-019-1274-4

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