遗迹对环境化学品的遗传反应之间的联系

为什么inpiduals对同一环境有不同的反应?来自北卡罗来纳州立大学和俄勒冈州立大学的研究人员已经针对与相同环境化学品的不同反应相关的斑马鱼的遗传差异。该工作可能对识别解释差异化学敏感性的遗传因素有影响。

“我们认为,史式遗传学和环境之间的相互作用是回答问题的关键,”为什么一些药物对某些人来说很好,但不是其他人?“或”为什么污染影响人们不同?“”大卫雷夫说,NC国家生物学副教授和该研究的相应作者。“我们想解决两个相关问题:在我们暴露的所有成千上万的化学物质中,做一些引发差异敏感性?有没有解释差异敏感性的遗传因素?“

来自NC州和俄勒冈州的团队分析了高吞吐量筛选数据,以寻找响应化学曝光的互加变异模式:换句话说,他们寻找引发辛辛利不同反应的化学品。最终,他们将数千次潜在的化学品缩小到一个:abamectin。Abamectin是一种常用的抗遗传性,在斑马鱼中表现出差异敏感性。

在一系列分析中,研究人员在早期发育阶段期间看着Apamectin对斑马鱼的影响。然后,它们比较了受影响(异常发育)的基因组(通常发育)而非受到影响(通常发育的或“健康”)斑马鱼并发现与基因SOX7的关系,这控制了身体在脊椎动物中的形式是如何形成的。受抹胸抑制的斑马鱼具有略微不同的SOX7基因变体,而不是未受影响的辛胺。此外,受影响的斑马鱼在靶向后续实验中表达了其SOX7基因的较低水平。

“本研究是证实史式的起点可以基于遗传概况对环境中的化学品不同,”Reif说。“我们的高吞吐量筛选方法使我们能够通过我们暴露的化学品快速排序,并寻找遗传和环境暴露之间的关系,而不是限于预选的候选风险。这项工作对精密药物,疾病预防和了解社区之间可能不同的风险有影响。“

该研究出现在环境健康观点中,由国家环境卫生研究所(GRANTS U01 ES027294,P42 ES005948,P30 ES025128,P42 ES016465,5T32 ES007329)提供支持。环境保护局(Star Grants 835168和835796);国家科学基金会研究生研究奖学金赠款号DGE-1252376。该团队包括前毕业生Michelle Balik-Meisner(第一作者)和来自NC州的伊丽莎白Scholl;和俄勒冈州立大学的Jane Rurong,Jane La du和Robert Tanguay。

出版物:Michele Balik-Meisner,等,“阐明与差别易感性相关的基因 - 逐群相互作用,”环境健康观点“,2018; DOI:10.1289 / EHP2662

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